Prácticas de Bioinformática Aplicada a la Genética en Veterinaria

INTRODUCCIÓN

CAPÍTULO 1. RECURSOS GENÉTICOS EN INTERNET: GENBANK YBLAST

1.1 Introducción

1.1.1 Recursos bioinformáticos y acceso a la información genética

1.1.2 El papel del NCBI y la base de datos GenBank

1.1.3 Herramientas de comparación de secuencias: BLAST

1.2 Objetivos

1.3 Materiales y recursos necesarios

1.4 Procedimiento

1.4.1 Introducción al flujo de trabajo bioinformático

1.4.2 Identificación de secuencias desconocidas con BLAST

1.4.3 Búsqueda y descarga de secuencias en GenBank

1.4.4 Comparación mediante alineamiento de dos o más secuencias

1.4.5 Registro e interpretación de resultados

1.5 Ejercicios prácticos

1.5.1 Ejercicio 1

1.5.2 Ejercicio 2

1.5.3 Ejercicio 3

CAPÍTULO 2. DISEÑO DE PRIMERS

2.1 Introducción

2.1.1 La importancia del diseño de primers en biología molecular

2.1.2 Consideraciones previas al diseño de primers

2.1.3 Herramientas informáticas disponibles para el diseño de primers

2.2 Objetivos

2.3 Materiales y recursos necesarios

2.4 Procedimiento

2.4.1 Selección de la secuencia diana

2.4.2 Análisis de las secuencias obtenidas

2.4.3 Diseño de primers con Primer3

2.5 Ejercicios prácticos

2.5.1 Casos propuestos

2.5.2 Información relevante

CAPÍTULO 3. GENÉTICA DE LA CONSERVACIÓN

3.1 Introducción

3.1.1 La genética como herramienta para la conservación de especies

3.1.2 Variabilidad genética y estructura poblacional

3.1.3 Aplicaciones de la genética de la conservación

3.2 Objetivos

3.3 Materiales y recursos necesarios

3.4 Procedimiento

3.4.1 Plan general

3.4.2 Caracterización genética de una población natural

3.4.3 Desarrollo de un plan de cría en cautividad

3.5 Conclusiones

CAPÍTULO 4. FILOGENÉTICA

4.1 Introducción

4.1.1 Fundamentos de la filogenia molecular

4.1.2 Aplicaciones del análisis filogenético en biología evolutiva

4.1.3 Métodos de inferencia filogenética

4.2 Objetivos

4.3 Materiales y recursos necesarios

4.4 Procedimiento

4.4.1 Plan general

4.4.2 Estimación de distancias genéticas a partir de secuencias de ADN

4.4.3 Construcción manual de árboles filogenéticos

4.4.4 Construcción de árboles filogenéticos con herramientas bioinformáticas

ANEXO

Anexo 1: Genotipado de la población natural del pinzón azul

Anexo 2: Hoja de Resultados 1

Anexo 3: Tabla de distribución de la chi-cuadrado

Anexo 4: Genotipado de la población cautiva del pinzón azul

Anexo 5: Hoja de Resultados 2

Anexo 6: Secuencias del 16S ribosomal de 6 especies de reptiles